Основная информация:
Академия Кросс – на первый взгляд вполне обычная частная школа. Ученики данного заведения подразделяются на Дневной (простой) и Ночной («элита») классы. Однако, не всё так просто. Академию основал Куросу Каен – охотник на вампиров и целью её создания явилось желание ректора помочь людям и вампир сосуществовать в мире. Посему Ночной класс полностью состоит из последних, хотя никто из учеников Дневного класса об этом и не подозревает. Хранителями тайны и, своего рода, чертой между двумя отделениями являются приёмные дети Каена – Куросу Юки и Кирю Зеро, они же -  старосты и ученики Дневного класса.
Глава Ночного класса – Куран Канаме, чистокровный вампир.

Конкретно сюжет:
Юки и Зеро «спокойно» учатся в Академии, ежедневно выполняя свои прямые обязанности. Однако солнечным денькам когда-то приходит конец… Юки узнаёт, что Зеро вампир и решает стать для него, своего рода, донором, позволяя пить свою кровь в моменты жажды. Канаме настаивает на переводе Кирю в Ночной класс, ибо считает оного опасным для человеческого общества, но останавливает его тот факт, что для охраны Юки Зеро должен остаться на Дневном отделении.
Тут формируется некий паритет, временное равновесие, позволяющее всем героям без проблем продолжать учебу, готовиться к экзаменам, балу, каникулам. Пускай, появились сложности, но они не мешают Академии Кросс являть собой пример равновесия сил - люди и вампиры по одну сторону баррикад.
Но кто же тогда с той, другой стороны? Все те же вампиры. Неужели вы думали, что все соглашаются с Канаме и Куросу? Кроме них существует Орден охотников и другие вампиры не менее сильные и влиятельные, чем Глава Куран. Они тщательно следят за Академией или же скрываются тут же, среди учеников, не вызывая у них ни малейшего подозрения, чего нельзя сказать о Ночном классе. Одна из таких чистокровных, проникших в академию не ради получения знаний и урегулирования отношений с людьми, Хио Шизука, вырезавшая когда-то семью Кирю и обратившая Зеро в вампира.
Лекции, учителя, звонки и перерывы на обед - обычная школа? В академии Кросс далеко не все так просто...